控制不佳的糖尿病，可能更容易罹患齿龈疾病或是口腔干燥。当血糖水平不稳定时，虚弱的身体无法对抗造成感染、伤害牙龈的细菌，这些感染情况恐引起口臭。但若是呼出的口气有水果味或是丙酮味(如去光水)，可能代表着「酮酸中毒」的糖尿病严重併发症，过多的酮酸累积在血液中，严重可能导致糖尿病患昏迷或死亡。
口气中带有如小便或是鱼腥味，可能意味着肾臟功能衰竭。肾臟负责移除血液中的有毒化学物质，一旦肾臟衰竭，肾臟损坏严重，无法再过滤血液中的有毒物质，导致毒素和废物不断累积无法排出，影响人体。当肾臟衰竭影响呼吸系统，引起呼吸问题，即可能造成口气中带有鱼腥味。
早上醒来，有口臭属正常现象，因为睡觉时唾液减少，使的造成臭味的细菌繁殖衍生。但唾液产量减少，有时是因为睡觉时，嘴巴不自觉张开时间太长;其他如有睡眠呼吸中止症和打呼的人，鼻子呼吸有问题，睡觉时嘴巴容易张开，进而导致口臭。
口臭也可能代表肠胃道功能不好，如胃食道逆流等消化疾病，可能从口气显现。因为患者的胃部无法有效处理食物，以致于食物开始腐化，少量未消化的食物可能迴流，引发口臭。
例如流感、支气管炎或是鼻窦炎等呼吸道感染，可能是口臭的根源。当呼吸道感染导致呼吸系统的组织发炎，恐触发产生餵养细菌的细胞和黏液。
另外，过敏或是鼻涕倒流可能导致鼻子堵塞，需要利用嘴巴呼吸，导致口腔干燥容易引起口臭。
当牙齿的珐琅质被侵蚀，食物的分子容易堆积在这些蛀牙的洞裡。刷牙也无法清除这些食物，导致细菌滋生、造成口臭。牙床若因为感染细菌而发炎，也会导致严重疼痛和发臭的分泌物。
