很多专家说，食饮对于身体的生理周期极为重要。现代的许多食物都含有多种化学添加物，可能会干扰人体内分泌，逆转生理周期，特别是在作物和养殖动物上添加的各种激素，旨在提高产量(肉、牛奶增加)，通过饮食进入体内，就会对内分泌造成影响。许多具有激素作用的污染物，如：双酚A…..等等都会影响生理周期。
除了食物的品质之外，饮食习惯也是会引起生理周期失常的要素。根据英国伦敦国王学院的糖尿病和营养科学院博士Gerda Pot的说法，摄取大量卡路里且不按固定时间饮食的人，比那些饮食时间正常的人更容易肥胖。而且不只会影响睡眠，还会影响到体内每一个细胞的生理时钟。
生理时钟失调的另一个原因是：生活习惯不佳、日夜颠倒、晚睡晚起、大量接触电磁波、远离自然环境等等，这些原因都使得生理周期逐渐偏离正轨，长时间下来就可能会导致生病。
如果长期暴露在人造光源(电灯)之下，也会改变生理时钟。夜晚的黑暗是最自然的因素，它是身体休息、再生、修复的时间。电灯、电视机或是手机的人造光源，会欺骗大脑「现在不是休息时间」，使得你的身体必须要超时工作，无法休息。
生活中的压力和都市的环境容易对身体产生较大的影响。根据一项研究，城市里的鸟类的生物钟似乎比城市之外的鸟类生物时钟来得更快。因为它们也变成了「夜猫子」，原因就在于人造光源的污染和各种噪音。
生理时钟失调会导致许多不同的后果，包括：疲劳、失眠、免疫力降低、生育能力下降和许多其他健康问题。但是，只要你及时调整自己的生活方式，让你的身体有机会休息，那么生理时钟很快就会恢复。远离城市可以帮助恢复生物时钟的正常运转。在科罗拉多大学博尔德分校进行的一项小型实验中，为期一周的营地旅行可以重新调整你失常的生理时钟。因为营地肯定会设置在户外，想当然的，这将有助于生物时钟适应日出而作，日落而息的。
