泡温泉过久，物极必反，不但无法补充皮肤所需的水分及矿物质，反而致使皮肤表面的油份大量流失，无法锁住水分，造成皮肤干燥而很痒。
准备生育的男性，泡温泉不能太频繁，时间更不能太久，否则就可能影响精子的数量和质量，甚至导致不育症。
泡温泉要因人而异，掌握好时间与温度。一般来说，温度在38℃左右，每次浸泡时间以不超过15分钟为宜。若高于38℃，最好在10分钟甚至5分钟以下，以免引起因血液循环过快而引起头晕或胸闷等现象。
劳累过度或用脑过度以及空腹浸泡等，则会引起晕厥甚至休克等等。
体质虚弱的人泡温泉出汗易虚脱，另外，已经发烧的人更不宜泡温泉。心脏病、高血压、低血压等疾病患者心脏及心血管功能较差，高温易导致心脏负荷增大，心跳加快、耗氧量提高，易出现供氧困难，引发危险，泡温泉要谨慎。
有时有的温泉富含的矿物质可能会对部分人群造成不良影响，如过敏，这导致皮肤出现红点，这种过敏现象无需药物治疗，几天之后就会自然消失。
饱食后浸泡温泉，会因为肠胃蠕动太快，导致恶心呕吐。
部分皮肤病患者，不宜泡温泉，民间向来盛传泡温泉有美肤的疗效，但对于患冬季痒、湿疹、异位性皮肤炎等的人，泡在热水中过久，由于加速皮肤水分的蒸发，破坏皮肤保护层，会恶化症状。
